ゾイド発掘現場で考古学者のカールKとの出会いを果たすアラシたち。そこでカールKは、パーツを寄せ集め、ラプトールを復元させようとしていた。しかし復元システムは無い。そこで、ペンネとヨウカンが復元システムを持つデスメタルの施設に潜入することに。しかしヨウカンは、Zボーイズたちに見つかってしまい…